MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rickettsia conorii str. Malish 7

Total Repeats: 6592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003103	ATT	2	6	832	837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003103	TTTA	2	8	865	872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003103	TGT	2	6	883	888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003103	TTG	2	6	938	943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003103	TGC	2	6	1015	1020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_003103	ATTT	2	8	1358	1365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003103	GTT	2	6	6018	6023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003103	T	7	7	6284	6290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003103	TAAA	2	8	6602	6609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003103	TCT	2	6	7862	7867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_003103	AAT	2	6	7905	7910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003103	T	7	7	7959	7965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003103	GAC	2	6	7999	8004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_003103	CAA	3	9	8018	8026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_003103	TA	3	6	9119	9124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003103	TAT	2	6	9136	9141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003103	CAA	2	6	9143	9148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_003103	ATG	2	6	9187	9192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003103	AGC	2	6	9204	9209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_003103	ATA	2	6	9237	9242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003103	TTC	2	6	9281	9286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_003103	CAA	2	6	9312	9317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_003103	A	7	7	9343	9349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003103	AAG	2	6	9387	9392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003103	AATTA	2	10	9393	9402	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003103	AT	3	6	9403	9408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003103	T	6	6	9417	9422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003103	T	6	6	9441	9446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003103	TTA	2	6	9496	9501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003103	TTAA	2	8	9510	9517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003103	GTG	2	6	9595	9600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003103	TA	3	6	9673	9678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003103	TCG	2	6	9703	9708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_003103	CGCTC	2	10	9745	9754	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_003103	TTA	2	6	9815	9820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003103	TTAG	2	8	11883	11890	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003103	TAA	2	6	11895	11900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003103	GTT	2	6	11916	11921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003103	GAA	2	6	11934	11939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003103	T	6	6	11995	12000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003103	AG	3	6	12010	12015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003103	T	6	6	12022	12027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003103	AT	3	6	12030	12035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003103	TCTT	2	8	12042	12049	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_003103	ATG	2	6	12063	12068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003103	TTG	2	6	14999	15004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003103	TG	3	6	15003	15008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003103	ATA	2	6	15061	15066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003103	A	7	7	15066	15072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003103	T	6	6	15088	15093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003103	CA	3	6	15149	15154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_003103	AGAACA	2	12	15178	15189	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_003103	T	9	9	15250	15258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003103	TTA	2	6	15264	15269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003103	TTA	2	6	15274	15279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003103	TTA	2	6	15348	15353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003103	T	6	6	15361	15366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003103	A	6	6	15633	15638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003103	A	6	6	15646	15651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003103	TA	3	6	16712	16717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003103	T	6	6	16718	16723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003103	T	6	6	16735	16740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003103	T	6	6	16764	16769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003103	TAC	2	6	16789	16794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_003103	TCC	2	6	16798	16803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_003103	TGA	2	6	16848	16853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003103	AAT	2	6	16927	16932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003103	AGTA	2	8	16938	16945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003103	AT	3	6	16956	16961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003103	AAAC	2	8	16988	16995	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_003103	AAT	2	6	17015	17020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003103	TAAA	2	8	17025	17032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003103	ATT	2	6	17064	17069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003103	AAT	2	6	17165	17170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003103	TA	3	6	17215	17220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003103	TTAT	2	8	17236	17243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003103	TTTAA	2	10	17273	17282	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003103	TA	3	6	23037	23042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003103	ACTA	2	8	23087	23094	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_003103	ACC	2	6	23141	23146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_003103	TATAA	2	10	23204	23213	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003103	AAT	2	6	23221	23226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003103	CAC	2	6	23242	23247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_003103	AGAAAA	2	12	23328	23339	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003103	TAC	2	6	23459	23464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_003103	AAC	2	6	23797	23802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_003103	TTAT	2	8	23803	23810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003103	TAA	2	6	23848	23853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003103	TTA	2	6	23866	23871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003103	AGCA	2	8	23877	23884	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_003103	AT	3	6	23890	23895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003103	CTT	2	6	23925	23930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_003103	AAT	2	6	24004	24009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003103	AAG	2	6	24092	24097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003103	CAAATA	2	12	24119	24130	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_003103	AGT	2	6	24139	24144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003103	A	6	6	24184	24189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003103	TAA	2	6	24203	24208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003103	TAA	2	6	24224	24229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003103	A	7	7	24228	24234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003103	TAAAGT	2	12	24282	24293	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003103	AG	3	6	24304	24309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003103	AAGT	2	8	24329	24336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003103	ATTA	2	8	24980	24987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003103	GAT	2	6	25004	25009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003103	TAC	2	6	25029	25034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_003103	ATT	2	6	25036	25041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003103	GAA	2	6	25123	25128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003103	GAA	2	6	25144	25149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003103	AT	3	6	25265	25270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003103	AAATA	2	10	25271	25280	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003103	GAT	2	6	25334	25339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003103	GTA	2	6	25406	25411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003103	ATG	2	6	25422	25427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003103	ATA	2	6	25619	25624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003103	TTTAGG	2	12	25676	25687	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003103	A	7	7	25714	25720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003103	A	6	6	25737	25742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003103	TAT	2	6	25763	25768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003103	A	6	6	25808	25813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003103	TAAA	2	8	25829	25836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003103	AT	4	8	25837	25844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003103	GATA	2	8	25917	25924	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003103	AAC	2	6	25935	25940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_003103	A	7	7	27403	27409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003103	TAAT	2	8	27418	27425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003103	A	6	6	27427	27432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003103	TAA	2	6	27477	27482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003103	A	6	6	27526	27531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003103	CGA	2	6	28634	28639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_003103	TAA	2	6	29616	29621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003103	TGCTA	2	10	29632	29641	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_003103	ATA	2	6	29648	29653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003103	GGA	2	6	29690	29695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003103	GTC	2	6	30256	30261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_003103	CTC	2	6	30306	30311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_003103	ACT	2	6	30407	30412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_003103	GCA	2	6	30438	30443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_003103	AT	3	6	32128	32133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003103	TA	3	6	32135	32140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003103	A	6	6	32142	32147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003103	TAA	2	6	32161	32166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003103	AAGTG	2	10	32172	32181	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003103	ATTTT	2	10	32184	32193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003103	ATA	3	9	32201	32209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003103	T	6	6	32220	32225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003103	AAG	2	6	32245	32250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003103	GTT	2	6	32341	32346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_003103	A	7	7	32399	32405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_003103	ATT	2	6	32487	32492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_003103	AAT	2	6	33593	33598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003103	TTC	2	6	34003	34008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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154	NC_003103	TGA	2	6	34113	34118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_003103	GAT	2	6	34188	34193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_003103	T	7	7	35248	35254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_003103	T	7	7	35305	35311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_003103	ATT	2	6	35343	35348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_003103	AT	3	6	36195	36200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_003103	TAT	2	6	36296	36301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_003103	GAG	2	6	36320	36325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_003103	GA	3	6	36328	36333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
168	NC_003103	GTG	2	6	36366	36371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_003103	TCA	2	6	37201	37206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_003103	ATA	2	6	37352	37357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_003103	T	6	6	37653	37658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_003103	AT	3	6	37662	37667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_003103	ATT	2	6	37715	37720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_003103	CTT	2	6	37737	37742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_003103	T	6	6	37756	37761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_003103	TAT	2	6	38256	38261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_003103	TA	4	8	38379	38386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_003103	ATTG	2	8	38389	38396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
197	NC_003103	ATCTTT	2	12	38476	38487	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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282	NC_003103	AT	3	6	49878	49883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_003103	T	6	6	52469	52474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_003103	T	6	6	53208	53213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_003103	AT	3	6	53214	53219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_003103	ATT	2	6	84536	84541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_003103	ATA	2	6	85160	85165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_003103	TAA	2	6	94536	94541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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